Biology Experiments
ChIP assay는 단백질과 DNA와의 결합 유무를 확인 할 수 있는 실험 방법이다. 1. ChIP assay 목적 및 개요 ChIP assay의 목적은 단백질이 DNA와 결합하는지 확인하는 것이다. 단백질과 그 단백질이 결합한 DNA를 화학적으로 연결 시킨 뒤 단백질을 인지하는 항체를 이용하여 immunoprecipitation Continue reading ChIP assay 원리 / Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay 원리 / ChIP assay 목적
1. Genome editing의 기본 원리 유전자 편집의 (Genome editing) 기본 원리는 거의 동일하다.특정 부위를 인지하는 domain과 DNA를 절단하는 domain 크게 두 가지로 나뉘어져 있으며, 이것을 어떠한 것으로 사용 하는 가에 따라서 그 실험 방법이 달라진다고 생각하면 된다. Genome editing DNA Continue reading 크리스퍼 유전자 가위 원리 / CRISPR Cas9 유전자 가위 원리 / CRISPR Cas9 원리 / 크리스퍼 유전자 가위 활용 / CRISPR Cas9 활용 / 크리스퍼 유전자 가위 / CRISPR Cas9
유전자의 발현은 DNA -> mRNA -> protein으로 이루어지며 유전자가 기능을 수행하기 위한 일련의 과정을 “유전자의 발현”이라고 정의한다. 유전자 발현 (gene expression) 의 정의 유전자의 발현 (gene expression) 은 DNA에서 mRNA로 전사 (transcription) 가 일어난 후에 mRNA에서 단백질로 번역 (translation) 순서로 Continue reading 유전자 발현의 정의 및 개념
최근 옌리멍 박사의 논문이 화제가 되고 있다. 하지만 아직 논문으로 부르기는 좀 민망한 부분이 있다. 논문을 게재하기 위해서는 동료 과학자들의 review가 반드시 필요하다. 일반적인 학술지에 투고하게 되면 다음과 같은 프로세스를 거치게 된다. Editor가 먼저 투고된 논문의 내용을 확인하고 확인할 가치가 Continue reading [재미있는 과학이야기] COVID-19 바이러스 조작설 -코로나 바이러스는 만들어졌다?!
Pull down assay 프로토콜은 크게 두 가지 방법으로 나뉘나 순서에만 약간 차이가 있을 뿐 크게 다르지 않다. 정제된 단백질과 bead를 먼저 붙이는 방법 정제된 단백질과 다른 단백질과 반응시켜 단백질 복합체를 먼저 만드는 방법 두 가지 이다. 필자는 bead를 먼저 붙이기 Continue reading Pull down assay protocol / Pull down assay 프로토콜 / GST-pull down assay protocol / GST-pull down assay 프로토콜
신비한 실험 사전 논문 이해/해석 이거 하나면 끝납니다. 안녕하세요. Bio-Chae입니다. 생명과학에 대한 지식과 정보를 지속적으로 업데이트하기 위해서 노력중입니다. 오늘은 제가 쓴 e-book 하나를 소개해 드리려고 포스팅하게 되었습니다. 크몽이라는 사이트를 통해서 제가 쌓아온 노하우의 일부를 공개할까 합니다. 바로 이곳에서 판매중입니다. 많은 Continue reading [생명과학] 전자책 (논문 해석 및 실험 원리)
GST-Pull down assay의 목적은 단백질간의 상호작용 (interaction)을 확인하는 것이다. Pull down assay는 실험의 이름 그대로 “Pull down” “끌어당겨서” 단백질의 interaction을 확인하는 것이다. IP와 굉장히 유사한 부분이 있다. 하지만 기본 원리에 있어서 큰 차이가 있다. 1. GST-Pull down 원리 및 workflow Continue reading GST-pull down assay 원리 / pull down assay 원리
GST pull-down을 수행할 때 cell lysate와 GST가 tagging 된 protein을 섞어 주고 반응 이 잘 일어날 수 있는 환경을 조성하는 buffer를 넣어준 뒤 단백질들의 결합이 일어날 수 있도록 incubation 시켜준다. 이때 사용하는 buffer는 여러 종류가 있겠지만 가장 기본적인 buffer의 조성을 Continue reading GST pull-down assay buffer / GST pull-down assay 버퍼 / GST pull-down assay binding buffer / GST pull-down 버퍼
Western blot protocol은 크게 Sample preparation, Gel running, Transfer, Blocking, Antibody incubation, Detection이렇게 6가지로 구성되어 있다. 각각 step별로 실험방법과 주의사항을 알아보겠다. 1. Sample Preparation Culture dish에서 Cell harvest하여 EP tube로 옮긴 후 PBS를 이용하여 washing 하여 cell pellet을 얻는다. Cell Continue reading Western Blot Protocol / Western Blotting Protocol / Western Blot 프로토콜/ 웨스턴블롯 프로토콜
Western blot buffer에 대해서 알아보도록 하겠다. 필요한 buffer들의 종류에는 lysis buffer, sample loading buffer, running buffer, transfer buffer, blocking buffer, washing buffer 등이 있다. 1. Lysis buffer – RIPA buffer (radioimmunoprecipitation assay buffer) RIPA buffer는 ionic detergent인 sodium deoxycholate (SDC)가 Continue reading Western blot buffer 역할/ western blotting buffer 역할/ 웨스턴블롯 buffer 역할 / 웨스턴블롯 버퍼 역할
Western blot은 특정 단백질을 검출하기 위해서 사용하는 실험 방법이다. Sample preparing and loading SDS-PAGE Transfer to membrane Primary antibody and washing Secondary antibody and washing Detection 1. Western blotting 원리 Western blot은 세포나 조직에서 얻은 단백질들에서 특정 단백질 (specific protein)을 Continue reading Western blotting 원리 / western blot 원리 / western blot / 웨스턴블롯 원리 / 웨스턴블롯팅 원리 / SDS-PAGE 원리
어떤 buffer가 가장 적합한지 정하는 것에는 정답은 없다. 각 protein의 특성이 다르기 때문에 그 특성에 맞게 사용을 하는 것이 가장 좋다. Detergent의 경우로 예를 들자면 너무 강한 detergent가 포함되어 있는 경우에는 target의 protein-protein interaction 마저 깰 수 있지만 너무 약한 Continue reading Immunoprecipitation (IP) buffer / 면역침강법 buffer / EDTA 역할 / EGTA 역할