Biology Experiments
Primer의 정의 프라이머(primer)란 DNA 합성의 시작점이 되는 짧은 nucleotide 서열을 뜻하며 PCR (polymerase chain reaction), sequencing등에 사용된다. Primer 짜는 방법 primer를 짜는 방법을 알기 위해서는 taq polymerase의 특성부터 이해해야 한다. Taq polymerase는 생성되는 가닥에서 5′ -> 3′ 의 방향으로 DNA를 Continue reading Primer 짜는 방법 | Primer 짜는 법 | Primer 제작법
Zinc-finger nulease (ZNF)는 genome editing의 한 종류로 Zinc-finger domain을 이용하여 DNA 서열을 인지하고 Fork I endonucleas를 이용하여 DNA를 절단한다 1. Genome editing의 기본 원리 유전자 편집의 (Genome editing) 기본 원리는 거의 동일하다.특정 부위를 인지하는 domain과 DNA를 절단하는 domain 크게 두 Continue reading Zinc-finger nuclease 원리 / ZFN 원리 / Zinc-finger nuclease (ZFN)
ChIP assay는 단백질과 DNA와의 결합 유무를 확인 할 수 있는 실험 방법이다. 1. ChIP assay 목적 및 개요 ChIP assay의 목적은 단백질이 DNA와 결합하는지 확인하는 것이다. 단백질과 그 단백질이 결합한 DNA를 화학적으로 연결 시킨 뒤 단백질을 인지하는 항체를 이용하여 immunoprecipitation Continue reading ChIP assay 원리 / Chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay 원리 / ChIP assay 목적
GST-Pull down assay의 목적은 단백질간의 상호작용 (interaction)을 확인하는 것이다. Pull down assay는 실험의 이름 그대로 “Pull down” “끌어당겨서” 단백질의 interaction을 확인하는 것이다. IP와 굉장히 유사한 부분이 있다. 하지만 기본 원리에 있어서 큰 차이가 있다. 1. GST-Pull down 원리 및 workflow Continue reading GST-pull down assay 원리 / pull down assay 원리
어떤 buffer가 가장 적합한지 정하는 것에는 정답은 없다. 각 protein의 특성이 다르기 때문에 그 특성에 맞게 사용을 하는 것이 가장 좋다. Detergent의 경우로 예를 들자면 너무 강한 detergent가 포함되어 있는 경우에는 target의 protein-protein interaction 마저 깰 수 있지만 너무 약한 Continue reading Immunoprecipitation (IP) buffer / 면역침강법 buffer / EDTA 역할 / EGTA 역할
IP assay는 단백질을 다루는 실험이므로 모든 step에서 온도를 낮게 유지하는 것이 좋다. 왜냐하면 단백질은 고온에서 3차 구조가 변성되기 때문에 단백질의 결합에 영향을 줄 수 있기 때문이다. Immunoprecipitation protocol Preparing the lysates Pre-clearing the lysates (optional) Immunoprecipitation Binding A/G agarose bead Continue reading Immunoprecipitation (IP) 프로토콜 / IP 프로토콜 / Imunopreciptiation protocol / IP protocol
Immunoprecipitation 원리인 항원 항체 반응을 이용하여 단백질 간의 상호 결합을 (protein-protein interaction) 확인하는 실험 방법이다. 각 단백질들의 결합은 생명 활동을 조절하는데 있어서 아주 중요한 역할을 담당한다.단백질 간의 결합을 찾아내고 확인하는 것은 생체 내 여러 기작을 조절하는 메커니즘을 밝혀내는데 매우 중요하다. Continue reading Immunoprecipitation 원리 / Immunoprecipitation principle / IP 원리 / IP principle / 면역침강법 원리