Biology Experiments
몰 농도 계산 앱 (Molality Calculator) 농도 계산에 필요한 시간을 줄이고 간단하게 계산을 끝낼 수 있는 몰 농도 계산 앱을 하나 추천하려고 한다. 다른 앱이 여러가지 있겠지만 필자는 이 몰 농도 계산 앱을 주로 사용하고 있다. Fast Molality Caculator https://play.google.com/store/apps/details?id=ga.haro.molality&hl=en_US&gl=US Continue reading 몰 농도 계산 앱 / Molality calculator/ 실험실 필수 앱 / 몰 농도 계산기
Primer의 정의 프라이머(primer)란 DNA 합성의 시작점이 되는 짧은 nucleotide 서열을 뜻하며 PCR (polymerase chain reaction), sequencing등에 사용된다. Primer 짜는 방법 primer를 짜는 방법을 알기 위해서는 taq polymerase의 특성부터 이해해야 한다. Taq polymerase는 생성되는 가닥에서 5′ -> 3′ 의 방향으로 DNA를 Continue reading Primer 짜는 방법 | Primer 짜는 법 | Primer 제작법
1. RT-PCR vs qPCR vs RT-qPCR 논문이나 실험을 하다 보면 혼동되는 용어들이 종종 있다. 오늘은 그 중에 PCR에 관련된 용어를 정리해 보고자 한다. 유전자의 발현을 확인할 때 주로 사용하는 실험으로 RT-qPCR 이라는 것이 많이 사용된다 (관련 포스팅: 유전자의 발현 정의 Continue reading Revers transriptation – PCR / Quantitative real time – PCR (qPCR) / Reverse transcription quantitative real-time PCR (RT-qPCR) 원리 및 비교
Sequence alignment란 DNA, RNA, 또는 단백질 서열 사이의 기능적, 구조적인 상관 관계를 밝혀 내기 위해서 서열을 비교하여 상호 유사한 구간을 찾는 과정이다 1. Sequence alignment (염기서열 일치 분석) 오늘은 생물학 관련 연구를 하다 보면 꼭 알아야 하는 sequence alignment에 대해서 Continue reading Amino acid sequence alignment 방법 / Amino acid sequence alignment tool / Sequence alignment / NCBI BLAST사용법 (2)
Sequence alignment란 DNA, RNA, 또는 단백질 서열 사이의 기능적, 구조적인 상관 관계를 밝혀 내기 위해서 서열을 비교하여 상호 유사한 구간을 찾는 과정이다 1. Sequence alignment (염기서열 일치 분석) 오늘은 생물학 관련 연구를 하다 보면 꼭 알아야 하는 sequence alignment에 대해서 Continue reading Nucleotide sequence alignment 방법 / Nucleotide sequence alignment tool / Sequence alignment / NCBI BLAST사용법 (1)
생명과학 분야에서 논문을 검색하는 것은 굉장히 중요하다. 새로운 논문 한편을 쓰기 위해서는 방대한 양의 지식이 필요할 뿐만 아니라 참고문헌 (citation)역시 매우 중요한 부분을 차지하고 있기 때문이다. 따라서 내가 원하는 논문을 검색하고 다운 받는 것은 굉장히 중요하다. 오늘은 그 방법에 대해서 Continue reading 사이허브 (Sci-hub) 이용 방법 / SCI 논문 무료 다운로드 방법 / SCI 해외 논문 무료 다운 방법 / 논문 무료로 보는 사이트 추천 / SCI 논문 다운로드 꿀팁 / Sci-hub
Talen은 genome editing의 한 종류로 Tal effector를 이용하여 DNA 서열을 인지하고 Fork I endonucleas를 이용하여 DNA를 절단한다 1. Genome editing의 기본 원리 유전자 편집의 (Genome editing) 기본 원리는 거의 동일하다.특정 부위를 인지하는 domain과 DNA를 절단하는 domain 크게 두 가지로 나뉘어져 Continue reading Transcription activator-like effector nucleases (Talen) 원리 / Talen 원리 / Genome editing 실험
벤 다이어그램 쉽게 그리기 (venn diagram) 오늘은 정말 간단하고 쉽게 벤 다이어그램 (venn diagram)을 그릴 수 있는 사이트 소개와 사용법에 대해서 포스팅 하겠다. 생물학을 연구 하다 보면 Microarray, RNA-seq 과 같은 macrodata를 많이 접하게 된다. 그리고 두 개 이상의 데이터에서 Continue reading 벤 다이어그램 (venn diagram) 그리는 사이트 / 벤 다이어그램 (venn diagram) 쉽게 그리기 / 벤 다이어그램 (venn diagram) 1분 완성 / 분자 생물학 연구하기 좋은 툴 #1
Zinc-finger nulease (ZNF)는 genome editing의 한 종류로 Zinc-finger domain을 이용하여 DNA 서열을 인지하고 Fork I endonucleas를 이용하여 DNA를 절단한다 1. Genome editing의 기본 원리 유전자 편집의 (Genome editing) 기본 원리는 거의 동일하다.특정 부위를 인지하는 domain과 DNA를 절단하는 domain 크게 두 Continue reading Zinc-finger nuclease 원리 / ZFN 원리 / Zinc-finger nuclease (ZFN)
Stripping 의 목적은 이미 결합된 항체를 제거하고 다른 항체를 결합시킨 결과를 얻기 위함이다. 1. Stripping 이란? Western blot stripping은 membrane에 붙였던 항체를 제거하고 다른 항체를 붙이는 것을 뜻한다. 영어 단어 strip (옷을 벗기다) 의 뜻처럼 이미 결합되어 있는 항체를 벗겨내고 Continue reading Stripping buffer 원리 / western blot stripping buffer 원리
GSEA 는 유전자들이 두 가지의 조건에서 통계적으로 의미 있는 연관성이 있는지 확인하는 실험 방법이다. 1. Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) 의 목적 이 실험 방법은 우리가 흔히 말하는 bench work이 아니다. Bench work은 우리가 실험대에 앉아서 하는 실험들을 주로 bench Continue reading Gene Set Enrichment Analysis 해석 / GSEA 해석 / Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)
RIPA lysis buffer는 빠르고 효과적을 세포를 lysis할 수 있고 단백질들을 안정화 하는 능력이 뛰어난 buffer이다. 그래서 mammalian cell을 lysis하는데 주로 사용되는 buffer이다. 이 buffer는 비특이적인 단백질의 결합을 최소화 하여 background가 적다는 장점이 있지만 SDC, SDS와 같은 detergent들이 포함되어 있으므로 단백질의 Continue reading RIPA lysis buffer의 역할 및 조성